Школа № 90 была основана в 1964 году, в рабочем районе, объединяющем три крупных завода: «Сибтяжмаш», «Сибсталь», «Красмаш». 1 сентября 1964 года прозвенел самый первый звонок в новой, только что построенной восьмилетней школе. 140 первоклассников и 35 первых учителей переступили ее порог. Район быстро застраивался, и уже в 1967 году только начальных классов в школе насчитывалось 24.
Идеология того времени требовала от нашего образовательного учреждения подготовку кадров для промышленных предприятий. Вчерашние выпускники становились сменой своих отцов на заводах. Для учеников проходили встречи с передовиками производства, школьники собирали металлолом для строительства кранов. А после уроков спешили в ДК «Сибтяжмаш» на занятия в кружках.
На протяжении многих лет пионерская и комсомольская организации школы носили имя Ф.Э. Дзержинского, одного из основателей Советской власти. В школе действовал музей его имени, поддерживалась связь с участниками Октябрьской революции и Великой Отечественной войны, лучшие ученики школы несли Вахту Памяти на Посту №1 у Вечного Огня на Красной площади.
В то время все это способствовало формированию основ гражданско-патриотического воспитания и образования.
Именно в этот период формировался опыт ученического самоуправления, где все участники образовательного процесса были включены в строгую систему воспитательных взаимоотношений.
Новый этап в жизни России, начавшийся в 1991 году, существенно повлиял на развитие детского самоуправления. В каждой школе начался поиск своего пути решения проблемы участия детей в управлении своими коллективами.
Но школа, как социальный институт, не могла отказаться от того опыта деятельности, который мог и в новых условиях способствовать развитию инициативы и самостоятельности детей. Авторитарные методы не всегда срабатывали или не давали ожидаемого результата. И в 1999 году школа включилась в движение общественно-активных школ, что способствовало разработке концепции гражданского образования.
В 2001 году был разработан проект «Школа Гражданина», позволяющий учащимся сформировать у себя лично значимые гражданские позиции на основе демократических ценностных ориентиров.
В 2003 году было создано детское общественное объединение «Доброволец».
С 2018 года в школе успешно действует военно-патриотический клуб «Вымпел» им. А.П. Гриболева, а в 2019 году активные учащиеся школы включились в Российское движение школьников.
С 10 августа 2020 года произошло слияние двух учреждений: МАОУ СШ № 49 была реорганизована путем присоединения к МАОУ СШ № 90.
Во главе педагогического коллектива всегда стояли настоящие профессионалы:
1964 год – директор Валентина Вениаминовна Горелова – 1 год, 3 месяца.
1965 год – директор Владимир Васильевич Горбатов – 15 лет
1980 год – директор Геннадий Степанович Исупов – 2 года
1982 год – директор Светлана Алексеевна Репей – 1 год
1983 год – директор Вера Васильевна Сергеева – 4 года
1987 год – директор Светлана Алексеевна Репей – 9 лет
1996 год – и.о. директора Юрий Георгиевич Арчинеков – 1 год
1997 год – Ольга Владимировна Цуканова – 17 лет
С 2014 года и по настоящее время – Елена Николаевна Богуш
ТАРАСКИНА ТАТЬЯНА ИВАНОВНА
ГОРШЕЧНИКОВА ЛАРИСА ДМИТРИЕВНА
